Strain | Pseudomonas aeruginosa 2192 supercont1.1 genomic scaffold, whole genome shotgun sequence. [Details] | |
DNA Sequence Upstream of Gene |
GATGATCGCCCACGGTCTCTCCGCCGCGGCGCTGTTCATCCTCTGCGGCCAGCTCTACGAGCGCCTGCATACCCGCGACATGCGCAAGATGGGCGGCCTG TGGTCGCGCATGCCCTACCTGCCGGCGATCAGCCTGTTCTTCGCCTCGGCGTCGCTGGGCCTGCCCGGTACCGGCAACTTCGTCGGGGAGTTCCTGATCC TGATCGGCGCCTTCAAGGTGGTCCCGGTGATCATCGTGATCGCCACCTTCGGCCTGGTCTTCGCCTCGGTCTACTCGCTGATCATGATCCACCGCGCCTA TTTCGGCCCCAGCCAGTCCGACGAGCCGATCCTCGGCCTCAACGCCCGCGAACTGAGCATGGTGCTCGGCCTGGCGGTCCTGCTGGTCCTGCTCGGGGTC TACCCGCAGCCGGTGCTGGACATCTCCGCGGCCAGCATGCACGGCGTGCAGCAATGGCTGGGCGCAGCCCTTTCCACCCTTGCAGGACGGTAGTCGCGAA
|
|
DNA Sequence for Gene |
>PA2G_01763
ATGACCTTTACGATCCAACACTTCATCGCGCTCCTGCCACTGCTGATCACCAGCGCCACCCTGGTGGTGGTGATGCTGGCGGTAGCCTGGAAACGCAATC ACTCGTTCACCGCCACCCTCTCGGTGATCGGCCTCAACCTGGCCCTGCTGTCGCTGCTGCCGGTCCTCGGCGTCACCCCGATCGAGGTGACCCCGCTGGT CCTGGTGGACAACTACGCCTGCTTCTACATGGCCCTGGTGCTGGTCTCCGCCCTGGCCTGCGTGACCCTCGCCCACGCCTACATGGAAAGCTATCCGGGT AACCGCGAAGAGCTGTACCTGCTCCTGCTGCTGGCCACCGCCGGCGGCCTGGTGCTGGTCAGCGCGCAACACCTGGCCAGCCTGTTCATCGGCCTGGAGT TGCTCTCGGTCCCGGTCTACGGGATGGTCGCCTACGCCTTCTTCAACAAGCGCTCGCTGGAAGCCGGCATCAAGTACACCGTGCTCTCGGCCGCCGGCTC CGCCTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTCTACGCCGAGTCCGGTACCCTGGGCTTCGCCGGCCTTGGCGCCAAGGTCGCCGAGCACGTGCTGAGCGGT CCGCTGGTCAGCGTTGGCGTAGGCATGATGCTGGTCGGCCTGGGCTTCAAGCTGTCGCTGGTGCCCTTCCACCTGTGGACCCCGGATGTCTACGAAGGCG CCCCGGCGCCGGTCTCGGCGTTCCTCGCCACCGCCAGCAAGGTCGCGGTGTTCGCCGTGCTGCTGCGGCTGTTCCAGATCGCCCCTGCGGCCCTGGACAA CCAACTGCTGAACATCTCCCTGAGCGTCATCGCGGTCGCCTCGATCCTCTTCGGCAACCTGCTGGCACTGACCCAGAGCAACATCAAGCGCCTGCTCGGC TACTCGTCCATCGCCCACCTGGGCTACCTGCTGGTCGCCCTGATCGCCAGCAAGGGCATGGCCGTGGAAGCGGTCGGCGTCTACCTGGCCACCTACGTAC TGACCTCCCTCGGCGCGTTCGGCGTGATCACCCTGATGTCCACCCCGTACAGCGGCCGCGACGCCGATGCGCTGTTCGAGTACCGCGGCCTGTTCTGGCG CCGGCCGGTACTGACCGCGGTGATGACCGTGATGATGCTGTCGCTGGCAGGCATCCCGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACGTGATCGCGGTC GGCGTCGAGTCGCACCTGTGGTGGCTGATCGGCGCCCTGGTGCTGGGCAGCGCCATCGGCCTGTACTACTACCTGCGGGTCATGGTCACCCTGTTCCTGG TCGAGCCCGGCATCCGCCAGCACGACGCACCGTTCAACTGGGGCCAGCGCGCCGGCGGCATCATGCTGGTCGCCATCGCCCTGCTGGCGTTCTTCCTCGG CGTCTACCCGCAGCCGCTGCTGGAAATCCTCCAGCATTCCGGCCTGGCCCTCGCCGGCTGA
BLASTN Search
|
DIAMOND BLASTX Search (DIAMOND is faster than BLASTX)
|
|
DNA Sequence Downstream of Gene |
GTCGCCCGCTCCACGAAAACCCCGCCTCGGCGGGGTTTTTCTTTGGCCCGCCCCACGCACCCTGCCCCGCTGCCGTGGCATGCTCCGCGCTCCATGGATG AACCCGGAGGCCTCATGCCCACCTTCCACGAAATCGACGTCCTGCGACACAACAGCGCCAGTTGGGACGCCCAGGCCGCCCGTGACTGCGAATGGTCGCG ACCGGTCAGCGCCGAAGAGGTCGCCGCCGCACGCCGCGGCGACTGGGCGGTGAAGCTGACCCCGGGCGCGTTACCCGCTCACTGGCTGGGCGACGTACGC GGCCGCGAGATCCTCTGCCTGGCCTCGGCCGGCGGCCAGCAGGCGCCGATCCTTGCCGCCGCCGGCGCACAGGTCACGCTGTTCGACGCCTCGGCGGGAC AGCTGGACAAGGACCGCCAGGTCGCCGCCCGCGACCGCCTCGAACTGGCCTGCGTGCAGGGCGACATGCGCGACCTCTCGACCTTCGCCGATGCCTCCTT
|
|
Amino Acid Sequence |
>NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit N
MTFTIQHFIALLPLLITSATLVVVMLAVAWKRNHSFTATLSVIGLNLALLSLLPVLGVTPIEVTPLVLVDNYACFYMALVLVSALACVTLAHAYMESYPG NREELYLLLLLATAGGLVLVSAQHLASLFIGLELLSVPVYGMVAYAFFNKRSLEAGIKYTVLSAAGSAFLLFGMALLYAESGTLGFAGLGAKVAEHVLSG PLVSVGVGMMLVGLGFKLSLVPFHLWTPDVYEGAPAPVSAFLATASKVAVFAVLLRLFQIAPAALDNQLLNISLSVIAVASILFGNLLALTQSNIKRLLG YSSIAHLGYLLVALIASKGMAVEAVGVYLATYVLTSLGAFGVITLMSTPYSGRDADALFEYRGLFWRRPVLTAVMTVMMLSLAGIPLTAGFIGKFYVIAV GVESHLWWLIGALVLGSAIGLYYYLRVMVTLFLVEPGIRQHDAPFNWGQRAGGIMLVAIALLAFFLGVYPQPLLEILQHSGLALAG
BLASTP |
DIAMOND BLASTP (DIAMOND is faster than BLASTP)
Search for conserved domains in this protein at NCBI CDD site
|