Strain | Pseudomonas aeruginosa PA7 chromosome, complete genome. [Details] | |
DNA Sequence Upstream of Gene |
GATGATCGCCCACGGCCTCTCCGCCGCGGCGCTGTTCATCCTCTGCGGCCAGCTCTACGAGCGCCTGCACACCCGCGACATGCGCAAGATGGGTGGCCTG TGGTCGCGCATGCCGTACCTGCCGGCGATCAGCCTGTTCTTCGCCTCGGCGTCGCTGGGCCTGCCCGGCACCGGCAACTTCGTCGGCGAGTTCCTGATCC TGATCGGCGCCTTCAAGGTGGTCCCGGTGATCATCGTGATCGCCACCTTCGGCCTGGTCTTCGCCTCGGTCTATTCGCTGATCATGATCCATCGCGCCTA CTTCGGCCCCAGCCAGTCCGACGAGCCGATCCTCGGCCTCGACGCCCGCGAACTGAGCATGGTGCTCGGCCTGGCGGTGCTGCTGGTCCTGCTCGGGGTC TACCCGCAGCCGGTGCTGGACATCTCCGCGGCCAGCATGCACGGCGTGCAGCAATGGCTGGGCGCAGCCCTTTCCACCCTTGCAGGACGGTAGTCGCGAA
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DNA Sequence for Gene |
>PSPA7_2557
|nuoN
ATGACCTTTACGATCCAACACTTCATCGCGCTCCTGCCACTGCTGATCACCAGCGCCACCCTGGTGGTGGTGATGCTCGCGGTAGCCTGGAAACGCAATC ACTCGTTCACCGCCACCCTGTCGGTGATCGGCCTCAACCTGGCCCTGCTGTCGATCCTGCCGGTCCTCGGCGTCACCCCGATCGAGGTGACCCCGCTGGT GCTGGTGGACAACTACGCCTGCTTCTACATGGCCCTGGTGCTGGTCTCCGCCCTGGCCTGCGTGACCCTCGCCCATGCCTACATGGAAAGCTATCCGGGT AACCGCGAAGAGCTGTACCTGCTCCTGCTGCTGGCCACCGCCGGCGGCCTGGTGCTGGTCAGCGCGCAGCACCTGGCCAGCCTGTTCATCGGCCTGGAGC TGCTCTCGGTCCCGGTCTACGGGATGGTCGCCTACGCCTTCTTCAACAAGCGCTCGCTGGAAGCCGGCATCAAGTACACCGTGCTGTCGGCCGCCGGTTC GGCGTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTCTACGCCGAGTCCGGTACCCTGGGCTTCGCCGGTCTCGGCGCCAAGGTCGCCGAGCACGTGCTGAGCGGT CCGCTGGTCGGCGTAGGCGTGGGCATGATGCTGGTCGGCCTGGGCTTCAAGCTGTCGCTGGTGCCCTTCCACCTGTGGACCCCGGACGTCTACGAAGGCG CCCCGGCGCCGGTCTCGGCGTTCCTCGCCACCGCCAGCAAGGTCGCGGTGTTCGCCGTGCTGCTGCGGCTGTTCCAGATCGCCCCGGCGGCCCTGGACAA CCAACTGCTGAACATCTCCCTGAGCGTCATCGCGGTCGCCTCGATCCTCTTCGGCAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACATCAAGCGCCTGCTCGGC TATTCGTCGATCGCCCACCTGGGCTACCTGCTGGTCGCCCTGATCGCCAGCAAGGGCATGGCGGTGGAAGCGGTCGGTGTCTACCTGGCGACCTATGTGC TGACCTCTCTCGGCGCGTTCGGCGTGATCACCCTGATGTCCACCCCGTACAGCGGTCGCGACGCCGATGCGCTGTTCGAGTACCGCGGCCTGTTCTGGCG CCGGCCGGTGCTGACCGCGGTGATGACCGTGATGATGCTGTCGCTGGCGGGCATCCCGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACGTGATCGCGGTG GGCGTCGAGTCGCACCTGTGGTGGCTGATCGGCGCCCTGGTGCTGGGCAGCGCCATCGGCCTGTACTACTACCTGCGGGTCATGGTCACCCTGTTCCTGG TCGAGCCGGGCATCCGCCAGCACGACGCGCCGTTCAACTGGGGCCAGCGCGCCGGCGGCATCATGCTGGTGGCCATCGCCCTGCTGGCATTCTTCCTCGG CGTCTACCCGCAGCCGCTGCTGGAGATCCTCCAGCATTCCGGCCTGGCCCTCGCCGGCTGA
BLASTN Search
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DIAMOND BLASTX Search (DIAMOND is faster than BLASTX)
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DNA Sequence Downstream of Gene |
GTCGCCCGCTCCACGAAAAACCCCGCCTCGGCGGGGTTTTTCTTTGGCCCGTCCCACGCCCCCTCCCCCGCTGCCATGGCATGCTCCGCGCTCCATGGAT GAACCCGGAGGCCTCATGCCCACCTTCCACGATATCGACATCCTGCGACACAACAGCGCCAGTTGGGACGCCCAGGCCGCCCGTGACTGCGAATGGTCGC GCCCGGTCGGCGCCGAGGAGGTCGCCGCCGCACGCCGCGGCGACTGGGCGGTGAAGCTGACCCCGGGCGCGTTACCCGCTCACTGGCTGGGCGACATACG CGGCCGCGAGATCCTCTGCCTGGCCTCGGCCGGCGGCCAGCAGGCGCCGATCCTCGCCGCCGCCGGCGCACGGGTCACACTGTTCGACGCCTCGGCGGGA CAGTTGGACAAGGACCGCCAGGTCGCCGCCCGCGATCGCCTCGAACTGGCCTGCGTGCAGGGCGACATGCGCGACCTCTCGACCTTCGCCGATGCCTCCT
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Amino Acid Sequence |
>NADH dehydrogenase subunit N
MTFTIQHFIALLPLLITSATLVVVMLAVAWKRNHSFTATLSVIGLNLALLSILPVLGVTPIEVTPLVLVDNYACFYMALVLVSALACVTLAHAYMESYPG NREELYLLLLLATAGGLVLVSAQHLASLFIGLELLSVPVYGMVAYAFFNKRSLEAGIKYTVLSAAGSAFLLFGMALLYAESGTLGFAGLGAKVAEHVLSG PLVGVGVGMMLVGLGFKLSLVPFHLWTPDVYEGAPAPVSAFLATASKVAVFAVLLRLFQIAPAALDNQLLNISLSVIAVASILFGNLLALTQSNIKRLLG YSSIAHLGYLLVALIASKGMAVEAVGVYLATYVLTSLGAFGVITLMSTPYSGRDADALFEYRGLFWRRPVLTAVMTVMMLSLAGIPLTAGFIGKFYVIAV GVESHLWWLIGALVLGSAIGLYYYLRVMVTLFLVEPGIRQHDAPFNWGQRAGGIMLVAIALLAFFLGVYPQPLLEILQHSGLALAG
BLASTP |
DIAMOND BLASTP (DIAMOND is faster than BLASTP)
Search for conserved domains in this protein at NCBI CDD site
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