Strain | Pseudomonas aeruginosa 3577 adTvG-supercont1.22, whole genome shotgun sequence. [Details] | |
DNA Sequence Upstream of Gene |
GATGATCGCCCACGGCCTCTCCGCCGCGGCGCTGTTCATCCTCTGCGGCCAGCTCTACGAGCGCCTGCATACCCGCGACATGCGCAAGATGGGCGGCCTG TGGTCGCGCATGCCCTACCTGCCGGCGATCAGCCTGTTCTTCGCCTCGGCGTCGCTGGGCCTGCCCGGTACCGGCAACTTCGTCGGGGAGTTCCTGATCC TGATCGGCGCCTTCAAGGTGGTCCCGGTGATCATCGTGATCGCCACCTTCGGCCTGGTCTTCGCCTCGGTCTACTCGCTGATCATGATCCACCGCGCCTA CTTCGGCCCCAGCCAGTCCGACGAGCCGATCCTCGGCCTCGATGCCCGCGAACTGAGCATGGTGCTCGGCCTGGCGGTCCTGCTGGTCCTGCTCGGGGTC TACCCGCAGCCAGTGCTGGACATCTCCGCGGCCAGCATGCACGGCGTGCAGCAATGGCTGGGCGCAGCCCTTTCCACCCTTGCAGGACGGTAGTCGCGAA
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DNA Sequence for Gene |
>AJ64_04643
ATGACCTTTACGATCCAACACTTCATCGCGCTCCTGCCACTGCTGATCACCAGCGCCACCCTGGTGGTGGTGATGCTGGCGGTAGCCTGGAAACGCAATC ACTCGTTCACCGCCACCCTCTCGGTGATCGGCCTCAACCTGGCCCTGCTGTCGCTGCTGCCGGTCCTCGGCGTCACCCCGATCGAGGTGACACCGCTGGT GCTGGTGGACAACTACGCCTGCTTCTACATGGCCCTGGTGCTGGTCTCCGCCCTGGCCTGCGTGACCCTCGCCCACGCCTACATGGAAAGCTATCCGGGT AACCGCGAAGAGCTGTACCTGCTCCTGCTGCTGGCCACCGCCGGCGGCCTGGTGCTGGTCAGCGCGCAGCACCTGGCCAGCCTGTTCATCGGCCTGGAGC TGCTCTCGGTCCCGGTCTACGGGATGGTCGCCTACGCCTTCTTCAACAAGCGCTCGCTGGAAGCCGGCATCAAGTACACCGTGCTCTCGGCCGCCGGCTC CGCCTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTCTACGCCGAGTCCGGTACCCTGGGCTTCGCCGGCCTTGGCGCCAAGGTCGCCGAGCACGTGCTGAGCGGT CCGCTGGTCAGCGTTGGCGTAGGCATGATGCTGGTCGGCCTGGGCTTCAAGCTGTCGCTGGTGCCCTTCCACCTGTGGACCCCGGATGTCTACGAAGGCG CCCCGGCGCCGGTCTCGGCGTTCCTCGCCACCGCCAGCAAGGTCGCGGTGTTCGCCGTGCTGCTGCGGCTGTTCCAGATCGCCCCTGCGGCCCTGGACAA CCAACTGCTGAACATCTCCCTGAGCGTCATCGCGGTCGCCTCGATCCTCTTCGGCAACCTGCTGGCACTGACCCAGAGCAACATCAAGCGCCTGCTCGGC TACTCGTCCATCGCCCACCTGGGCTACCTGCTGGTCGCCCTGATCGCCAGCAAGGGCATGGCCGTGGAAGCGGTCGGCGTCTACCTGGCTACCTACGTAC TGACCTCCCTCGGCGCGTTCGGCGTGATCACCCTGATGTCCACCCCGTACAGCGGCCGCGACGCCGATGCGCTGTTCGAGTACCGCGGCCTGTTCTGGCG CCGGCCGGTACTGACCGCGGTGATGACCGTGATGATGCTGTCGCTGGCAGGCATCCCGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACGTGATCGCGGTC GGCGTCGAGTCGCACCTGTGGTGGCTGATCGGCGCCCTGGTGCTGGGCAGCGCCATCGGCCTGTACTACTACCTGCGGGTCATGGTCACCCTGTTCCTGG TCGAGCCCGGCATCCGCCAGCACGACGCACCGTTCAACTGGGGCCAGCGCGCCGGCGGCATCATGCTGGTGGCCATCGCCCTGCTGGCGTTCTTCCTCGG CGTCTACCCGCAGCCGCTGCTGGAAATCCTCCAGCATTCCGGCCTGGCCCTCGCCGGCTGA
BLASTN Search
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DIAMOND BLASTX Search (DIAMOND is faster than BLASTX)
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DNA Sequence Downstream of Gene |
GTCGCCCGCTCCACGAAAACCCCGCCTCGGCGGGGTTTTTCTTTGGCCCGCCCCACGCACCCTGCCCCGCTGCCGTGGCATGCTCCGCGCTCCATGGATG AACCCGGAGGCCTCATGCCCACCTTCCACGATATCGACGTCCTGCGACACAACAGCGCCAGTTGGGACGCCCAGGCCGCCCGGGACTGCGAATGGTCGCG ACCGGTCAGCGCCGAAGAGGTCGCCGCCGCACGCCGCGGCGACTGGGCGGTGAAGCTGACCCCGGGCGCGTTACCCGCTCACTGGCTGGGCGACGTACGC GGCCGCGAGATCCTCTGCCTGGCCTCGGCCGGCGGCCAGCAGGCGCCGATCCTTGCCGCCGCCGGCGCACGGGTCACACTGTTCGACGCCTCGGCGGGAC AGCTGGACAAGGACCGCCAGGTCGCCGCCCGCGACCGCCTCGAACTGGCCTGCGTGCAGGGCGACATGCGCGACCTCTCGACCTTCGCCGATGCCTCCTT
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Amino Acid Sequence |
>NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit N
MTFTIQHFIALLPLLITSATLVVVMLAVAWKRNHSFTATLSVIGLNLALLSLLPVLGVTPIEVTPLVLVDNYACFYMALVLVSALACVTLAHAYMESYPG NREELYLLLLLATAGGLVLVSAQHLASLFIGLELLSVPVYGMVAYAFFNKRSLEAGIKYTVLSAAGSAFLLFGMALLYAESGTLGFAGLGAKVAEHVLSG PLVSVGVGMMLVGLGFKLSLVPFHLWTPDVYEGAPAPVSAFLATASKVAVFAVLLRLFQIAPAALDNQLLNISLSVIAVASILFGNLLALTQSNIKRLLG YSSIAHLGYLLVALIASKGMAVEAVGVYLATYVLTSLGAFGVITLMSTPYSGRDADALFEYRGLFWRRPVLTAVMTVMMLSLAGIPLTAGFIGKFYVIAV GVESHLWWLIGALVLGSAIGLYYYLRVMVTLFLVEPGIRQHDAPFNWGQRAGGIMLVAIALLAFFLGVYPQPLLEILQHSGLALAG
BLASTP |
DIAMOND BLASTP (DIAMOND is faster than BLASTP)
Search for conserved domains in this protein at NCBI CDD site
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