Pseudomonas sp. VLB120, PVLB_06090 (cobS)

Cytoplasmic
Cytoplasmic Membrane
Periplasmic
Outer Membrane
Extracellular
Unknown

Sequence Data

Strain Pseudomonas sp. VLB120, complete genome. [Details]
DNA Sequence Upstream of Gene
CCTGACCGAAAAAGGCTGGGTGCAGATGAGCGCGGCCGTAGAGGCAGGTGGGCCGTGGCAGGTGCTGGTCAGCTCGCCCTTGCAACGTTGCGCCCGCTTC GCCGACGCATTGGGCGAGCGGCTGGGCTTGTCGGTACAGCGTGAAGCCGATTTGCGAGAGCTGCACTTCGGCGACTGGGAGGGACGCACCGCGGCGCAAA TCATGCAGACCCAAGCCGATGAGCTTGGGCGTTTCTGGTCTGATCCCTATGCCTACACACCGCCTGGCGGGGAGCCGGTCGGCGCATTCGCCGAGCGGGT GGTCACGGCCATGGAGCGGCTGACGCGGCAGCATGCTGGCAAACGCGTGCTGCTGGTGACCCACGGCGGCGTGATGCGCCTGTTGCTGGCGCGAGCCCGT GGATTGCCCCGTGAGCAGTTATTGCAGGTCGAAGTTGGGCACGGCGCCATGGTGCGGTTGGTGTTGAATGAGGATGGTGTGTTGAGCGAGGCTGATTGAG
DNA Sequence for Gene
>PVLB_06090 |cobS
ATGGTGCCATTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTGAGCAGCTTGCCTGTACGGTTGCCGGGTATGCCGGCACCGCGAGACGTTGGTCGTTCGCTGCTGTGGT ATCCGGTGGTAGGGGTGTTGTTTGGCCTGCTGTTGTGGTTGGCCAGCCATCTGTTGAGTGGCACGCCTGCGCACCTGCATGCCGCATTGTTGCTGACGCT TTGGGTGCTGCTCAGCGGTGCCTTGCACCTGGATGGCCTGGCCGACAGCGCCGATGCCTGGCTGGGTGGCTTCGGTGACCGTGAGCGCACCCTGCACATC ATGAAGGATCCGCGCAGCGGACCGATTGCCGTCGTCACCCTGGTGCTGGTGCTGTTGTTGAAGTTCTGTGCGCTTTGGGTGCTGGTCGAGCGAGGCGCCG GCGCGGTGCTGGTGTTGGCGCCTTTGGTGGGCCGTAGCGCCATGCTCGGGTTGTTTCTGTCCACCCCTTACGTTCGGCCGGGAGGGCTTGGCCAGGCATT GGCCGAGCATCTGCCGCGTCGCGCCGGGGCCTGGGTATTGTCGGGTAGCTTGGTGCTGGGCCTGGCTCTGGTCGGCAGGTCGGCGATCTGGCCCTTGGTG GGCGCGTTGGCAGGCTTCTGGTGGTTGCGCCAGCTGATGTGTCGTCGATTGGGTGGGACCACCGGGGATACTGCCGGGGCGATGCTGGAATTGCTTGAGT TGGTGGTGTTGCTGGTCCTCGCGCTGACGAGGTGA
BLASTN Search  |  DIAMOND BLASTX Search (DIAMOND is faster than BLASTX)
DNA Sequence Downstream of Gene
ATGCGTCATCGCCAGCATGCCGTCACCCGCAGCGGTCGGGTGCTGAAATTTCTTGCAACACGCTATAAGCGGGTATATACACGTAACCATGTTGACCAGT GAATGCATCTGCACGCACCTGCGCCGAGCCGCTCGCGGGGTGAGCCGACACTATGACGAGGCCCTTGCCGGCTTCGGCATCAATGTCGCCCAGTTTTCCC TACTGCGCCACCTTCAGCGGCTGGATCGTCCGAGTATCACCACGTTGGCCGAGGCCATGGGCCTTGAACGCAGTACCTTGGGTCGCAACCTGCGGGTGCT CGAGGCCGAAGGGTTGGTGGCCTTGGCTGACGGCGACGACCAGCGTAACCGTGTGGTGCTGTTGACCGACGAGGGTACGGCGCGGTTGCAGCTGGCCTAT CCGGCCTGGCAGCAGGCGCAGCGACAGTTGGTGGAGCAACTGGGTGAGGGCGCGCGGGATGAGTTGGTACGTCTGCTGGAGCGGCTTGCCTGATCAACTA
Amino Acid Sequence
>cobalamin synthase
MVPFWIALQFLSSLPVRLPGMPAPRDVGRSLLWYPVVGVLFGLLLWLASHLLSGTPAHLHAALLLTLWVLLSGALHLDGLADSADAWLGGFGDRERTLHI MKDPRSGPIAVVTLVLVLLLKFCALWVLVERGAGAVLVLAPLVGRSAMLGLFLSTPYVRPGGLGQALAEHLPRRAGAWVLSGSLVLGLALVGRSAIWPLV GALAGFWWLRQLMCRRLGGTTGDTAGAMLELLELVVLLVLALTR
BLASTP | DIAMOND BLASTP (DIAMOND is faster than BLASTP)
Search for conserved domains in this protein at NCBI CDD site