Strain | Pseudomonas aeruginosa BWHPSA003 genomic scaffold adggi-supercont1.1, whole genome shotgun sequence. [Details] | |
DNA Sequence Upstream of Gene |
GATGATCGCCCACGGCCTCTCCGCCGCGGCGCTGTTCATCCTCTGCGGCCAGCTCTACGAGCGCCTGCATACCCGCGACATGCGCAAGATGGGCGGCCTG TGGTCGCGCATGCCCTACCTGCCGGCGATCAGCCTGTTCTTCGCCTCGGCGTCGCTGGGCCTGCCCGGTACCGGCAACTTCGTCGGGGAGTTCCTGATCC TGATCGGCGCCTTCAAGGTGGTCCCGGTGATCATCGTGATCGCCACCTTCGGCCTGGTCTTCGCCTCGGTCTACTCGCTGATCATGATCCACCGCGCCTA CTTCGGCCCCAGCCAGTCCGACGAGCCGATCCTCGGCCTCGATGCCCGCGAACTGAGCATGGTGCTCGGCCTGGCGGTCCTGCTGGTCCTGCTCGGGGTC TACCCGCAGCCAGTGCTGGACATCTCCGCGGCCAGCATGCACGGCGTGCAGCAATGGCTGGGCGCAGCCCTTTCCACCCTTGCAGGACGGTAGTCGCGAA
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DNA Sequence for Gene |
>Q016_01725
ATGACCTTTACGATCCAACACTTCATCGCGCTCCTGCCACTGCTGATCACCAGCGCCACCCTGGTGGTGGTGATGCTGGCGGTAGCCTGGAAACGCAATC ACTCGTTCACCGCCACCCTCTCGGTGATCGGCCTCAACCTGGCCCTGCTGTCGCTGCTGCCGGTCCTCGGCGTCACCCCGATCGAGGTGACACCGCTGGT GCTGGTGGACAACTACGCCTGCTTCTACATGGCCCTGGTGCTGGTCTCCGCCCTGGCCTGCGTGACCCTCGCCCACGCCTACATGGAAAGCTATCCGGGT AACCGCGAAGAGCTGTACCTGCTCCTGCTGCTGGCCACCGCCGGCGGCCTGGTGCTGGTCAGCGCGCAGCACCTGGCCAGCCTGTTCATCGGCCTGGAGC TGCTCTCGGTCCCGGTCTACGGGATGGTCGCCTACGCCTTCTTCAACAAGCGCTCGCTGGAAGCCGGCATCAAGTACACCGTGCTCTCGGCCGCCGGCTC CGCCTTCCTGCTGTTCGGCATGGCCCTGCTCTACGCCGAGTCCGGTACCCTGGGCTTCGCCGGCCTTGGCGCCAAGGTCGCCGAGCACGTGCTGAGCGGT CCGCTGGTCAGCGTTGGCGTAGGCATGATGCTGGTCGGCCTGGGCTTCAAGCTGTCGCTGGTGCCCTTCCACCTGTGGACCCCGGATGTCTACGAAGGCG CCCCGGCGCCGGTCTCGGCGTTCCTCGCCACCGCCAGCAAGGTCGCGGTGTTCGCCGTGCTGCTGCGGCTGTTCCAGATCGCCCCTGTGGCCCTGGACAA CCAACTGCTGAACATCTCCCTGAGCGTCATCGCGGTCGCCTCGATCCTCTTCGGCAACCTGCTGGCACTGACCCAGAGCAACATCAAGCGCCTGCTCGGC TACTCGTCCATCGCCCACCTGGGCTACCTGCTGGTCGCCCTGATCGCCAGCAAGGGCATGGCCGTGGAAGCGGTCGGCGTCTACCTGGCTACCTACGTAC TGACCTCCCTCGGCGCGTTCGGCGTGATCACCCTGATGTCCACCCCGTACAGCGGCCGCGACGCCGATGCGCTGTTCGAGTACCGCGGCTTGTTCTGGCG CCGGCCGGTACTGACCGCGGTGATGACCGTGATGATGCTGTCGCTGGCAGGCATCCCGCTGACCGCCGGCTTCATCGGCAAGTTCTACGTGATCGCGGTC GGCGTCGAGTCGCACCTGTGGTGGCTGATCGGCGCCCTGGTGCTGGGCAGCGCCATCGGCCTGTACTACTACCTGCGGGTCATGGTCACCCTGTTCCTGG TCGAGCCCGGCATCCGCCAGCACGACGCACCGTTCAACTGGGGCCAGCGCGCCGGCGGCATCATGCTGGTCGCCATCGCCCTGCTGGCGTTCTTCCTCGG CGTCTACCCGCAGCCGCTGCTGGAAATCCTCCAGCATTCCGGCCTGGCCCTCGCCGGCTGA
BLASTN Search
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DIAMOND BLASTX Search (DIAMOND is faster than BLASTX)
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DNA Sequence Downstream of Gene |
GTCGCCCGCTCCACGAAAACCCCGCCTCGGCGGGGTTTTTCTTTGGCCCGCCCCACGCACCCTGCCCCGCTGCCGTGGCATGCTCCGCGCTCCATGGATG AACCCGGAGGCCTCATGCCCACCTTCCACGAAATCGACGTCCTGCGACACAACAGCGCCAGTTGGGACGCCCAGGCCGCCCGTGACTGCGAATGGTCGCG ACCGGTCAGCGCCGAAGAGGTCGCCGCCGCACGCCGCGGCGACTGGGCGGTGAAGCTGACCCCGGGCGCGTTACCCGCTCACTGGCTGGGCGACGTACGC GGCCGCGAGATCCTCTGCCTGGCCTCGGCCGGCGGCCAGCAGGCGCCGATCCTTGCCGCCGCCGGCGCACGGGTCACGCTGTTCGACGCCTCGGCGGGAC AGCTGGACAAGGACCGCCAGGTCGCCGCCCGCGACCGCCTCGAACTGGCCTGCGTGCAGGGCGACATGCGCGACCTCTCGACCTTCGCCGATGCCTCCTT
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Amino Acid Sequence |
>NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit N
MTFTIQHFIALLPLLITSATLVVVMLAVAWKRNHSFTATLSVIGLNLALLSLLPVLGVTPIEVTPLVLVDNYACFYMALVLVSALACVTLAHAYMESYPG NREELYLLLLLATAGGLVLVSAQHLASLFIGLELLSVPVYGMVAYAFFNKRSLEAGIKYTVLSAAGSAFLLFGMALLYAESGTLGFAGLGAKVAEHVLSG PLVSVGVGMMLVGLGFKLSLVPFHLWTPDVYEGAPAPVSAFLATASKVAVFAVLLRLFQIAPVALDNQLLNISLSVIAVASILFGNLLALTQSNIKRLLG YSSIAHLGYLLVALIASKGMAVEAVGVYLATYVLTSLGAFGVITLMSTPYSGRDADALFEYRGLFWRRPVLTAVMTVMMLSLAGIPLTAGFIGKFYVIAV GVESHLWWLIGALVLGSAIGLYYYLRVMVTLFLVEPGIRQHDAPFNWGQRAGGIMLVAIALLAFFLGVYPQPLLEILQHSGLALAG
BLASTP |
DIAMOND BLASTP (DIAMOND is faster than BLASTP)
Search for conserved domains in this protein at NCBI CDD site
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